睿联实时渲染虚拟仿真小型机应用之五:活体细胞动力分析系统
  • Cong
  • 2009年03月12日 10:53
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目前,大部分细胞检测方法采用的仍是传统的终点法——仅仅是给实验定格了一个最终结果,而且经常需要标记和破坏细胞。这就是当前细胞分析方法的最大限制,因为细胞是活体,其生物学和细胞进程是动态而非静态的。因此,为了更充分的了解和测量生物学和细胞进程,应当使用一种非侵入性的系统,来记录细胞应答某些刺激(如药物处理或某种生长因子刺激)时所产生的动态变化。 目前,国外研究进行活体细胞动力分析已进入纳米级,纳米级分子动力学(NAMD)以及视觉分子动力学(VMD)都是功能强大且应用广泛的工具软件,它们被用于生物分子过程的模拟和可视化。但是,模拟复杂的分子系统是一件耗时的工作,而且还需要使用巨大、复杂的计算机群集才能完成。

睿联实时渲染虚拟仿真小型机应用之五:活体细胞动力分析系统

睿联嘉业Plex D2型实时渲染虚拟仿真小型机在离子模拟方面的速度了比18颗CPU的群集高出了100多倍(以CPU总时间对比GPU总时间为基础计算得出)。该机采用NVIDIA 最新Quadro® Plex 可视化处理系统(VCS),实现了虚拟仿真实时渲染可视化运算密度的巨大飞跃,带来突破性的处理效率和处理能力。采用一台三颗GPU的工作站时,类似的视觉分子动力学工具中的时均化静电运算达到了705 Gigaflops的浮点性能。这种超高的性能让所有生物学研究人员的工作站均能够达到等同于计算群集的计算能力。

睿联实时渲染虚拟仿真小型机应用之五:活体细胞动力分析系统

有了GPU计算,分子模拟就不再受到群集的服务器空间限制了。通过在个人实验室的工作站以及台式机上运行模拟,项目不再因计算资源稀缺而互相争抢。与从前只能排队等待处理相反,研究人员在需要时可及时获得运算结果。而且,大型服务器群集拥有了GPU之后,更复杂的难题就能够得以解决。而这种计算能力在以前还只是一个梦想。 利用全国最快的超级计算机来解读活体细胞的最小组件,正在加速药品研究以及解释生物进程中其它至关重要的研究步伐。 观摩热线:400-650-8282,010-88553466,13521439980,13126624383,www.super-view.com.cn

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