现在智能手机的竞争已经从拼硬件、拼配置开始向比功能、比体验方向发展，所以“软实力”也就是系统方面的重要性越来越大。不过目前许多厂商优先考虑旗舰机型，而忽视了对旗下入门机的及时适配，所以用着老版本ROM的入门机比比皆是。
不过魅族并没有把魅蓝Note当作普通的入门机，刚一发布就已经适配了最新的Flyme 4.2系统，甚至比魅族MX4当前的Flyme 4.1还要先进，比如里面的“驾驶模式”就是此前没有过的。
除此之外，魅蓝Note也支持便捷的“悬浮球”，支持双卡双待，支持双击亮屏、熄屏手势等体感功能，功能上丝毫不逊于魅族MX4。
依旧是美美的Flyme系统，除了更加修长外，与MX4界面没有什么不同。
魅蓝Note是魅族旗下首款支持双卡双待的机型，分为联通版和移动版，据称未来还会推出电信版，均支持4G网络。
从拨号界面可以看出，当插入两张卡时，数字键盘底部出现了拨号选择。在通话过程中，联系人的右上角也会实时显示当前所用的是哪张SIM卡。
魅蓝Note也加入了悬浮球功能，不过考虑到机身更加修长，将其位置进行了上移（位置不可改变），功能不变。
Flyme悬浮球总共提供六种手势：单击返回、双击全屏下拉、左右划动切换应用、下划调出通知栏、以及上划返回桌面。
魅族把自己的语音助手称作“小溪”，这是在Flyme 4.0中新加入的功能，魅族 MX3也仅是在12月23日更新的开发版中才加入的。
魅蓝Note同样支持双击亮屏、熄屏手势等快捷操作。
双击解锁速度方面，魅蓝Note丝毫不逊于魅族MX4，甚至比MX4 Pro还要快一些。
Flyme 4.2中新加入了“驾驶辅助”功能，支持来电、短信语音播报，自动播放音乐等服务。
