天猫魔盒M13依然采用阿里自家的YunOS系统，目前已经升级到了3.0版本，相比天猫魔盒2上的YunOS 2.0，界面和功能上发生了很大变化。
YunOS 2.0
现在的YunOS 3.0
左上角依然标注的“华数TV”字样，可见天猫魔盒的影视资源依然主要来自华数，这也是之前为何阿里花大钱投资华数的原因。
界面布局上，YunOS 3.0采用全新的双行界面设计，其中上面一行又分为左右两部分，最左侧是4个常用功能，用灰色磁贴展示，分别是通知中心、系统设置、历史记录以及最近使用（包括最近打开的APP和最近看的影视）。
右侧则是各种APP，正如同很多盒子，集结着影视、游戏、APP等不同板块入口。这里并没有将所有的APP摆出，在最右侧提供了一个“+”入口，可随时对要显示的APP进行增删。
下面一行则是“热门推荐”和“热门排行”，前者类似乐视电视的轮播功能，里面集成了多个频道，最大的好处是不开通会员也能把里面正在播放的视频单独提出来观看，不再被动接收。
值得一提的是，天猫魔盒M13同样采用了悬浮式桌面，在选择菜单的同时不影响观看视频。
YunOS 2.0
YunOS 3.0
系统设置部分，旧版界面比较简单，但是具体设置需要更多的操作步骤，而新版一目了然，每一项都能一键到达。
天猫魔盒与一般盒子的最大区别是，一般电视盒子也就集成影视、游戏、应用三大板块，而网购平台立身的阿里，已经将淘宝的触手伸向了天猫魔盒的每一个角落，里面不但集成了购物APP，而且在电视节目演员下面还推荐这同款衣服，你也可以用支付宝扫描购买游戏道具……
电视购物，手机淘宝扫码支付
《植物大战僵尸》可以直接用支付宝购买道具
遥控器集成了淘宝购物功能，阿里对电商的研究已经深入骨髓了。
天猫魔盒支持U盘安装App，这也是很多消费者最愿意看到的，可以极大丰富影视资源。
YunOS 3.0在资源方面最大的不同就是在“影视”中加入了“天猫影院”板块，天猫影院是阿里百亿重金打造的超级片库，拥有好莱坞六大电影公司正版授权2000部优质影片，160000小时电视剧，1200档综艺节目，2800小时独家纪录片。
不过该功能并不是免费的，而是分成包月付费和点映付费两种，从收录的片子来看，其丰富度和视频质量都有保证。但从价格来说，365元/年的价格（原价720元）虽然低于乐视会员，但还是有点小贵。如果未来能够加入用天猫积分、淘金币兑换无疑更好了。
