6月6日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例19例，其中境外输入病例14例（上海4例，广东3例，浙江2例，云南2例，辽宁1例，河南1例，四川1例），本土病例5例（均在广东）；无新增死亡病例；无新增疑似病例。
当日新增治愈出院病例8例，解除医学观察的密切接触者741人，重症病例与前一日持平。境外输入现有确诊病例303例（其中重症病例1例），现有疑似病例2例。累计确诊病例6151例，累计治愈出院病例5848例，无死亡病例。
截至6月6日24时，据31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例403例（其中重症病例10例），累计治愈出院病例86228例，累计死亡病例4636例，累计报告确诊病例91267例，现有疑似病例2例。累计追踪到密切接触者1030389人，尚在医学观察的密切接触者8509人。
31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者21例，其中境外输入19例，本土2例（均在广东）；当日转为确诊病例3例（境外输入2例）；当日解除医学观察16例（均为境外输入）；尚在医学观察的无症状感染者376例（境外输入342例）。
6月6日深夜，广州市南沙区新型冠状病毒肺炎疫情防控指挥部调整分级分类防控工作，恢复公交、地铁等运营。
根据广州市新型冠状病毒肺炎疫情防控指挥部第17号通告精神，结合南沙区新冠肺炎疫情防控实际情况，为保障广大市民健康安全和正常生产生活需求，有关疫情防控工作调整情况通告如下：
一、关于交通管制措施调整
（一）在南沙港区作业的货车，由广州港集团按照疫情防控工作要求，加强对进入港区车辆司机的防疫管理。
（二）南沙区（除南沙港区外）的货车，由货车运营管理单位履行疫情防控主体责任，加强司乘人员防疫管理后方可通行。
（三）客车司乘人员按照疫情防控常态化健康管理的要求，做好自我防护后方可通行。
（四）全区城市公交、地铁、高铁、出租车、网约车、长途客运、高快速路、码头，按照疫情防控常态化健康管理的要求，落实防护措施，恢复运营。运营单位负责做好司机、乘客体温测量及绿色健康码的检查。
二、经疫情风险评估，将南沙街越秀滨海新城20栋由封控管理调整为严格的健康管理。
