9月16日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例84例。其中境外输入病例22例（云南16例，河南2例，广东2例，上海1例，浙江1例），含2例由无症状感染者转为确诊病例（浙江1例，河南1例）；本土病例62例（福建61例，其中厦门市31例、莆田市28例、泉州市1例、漳州市1例；云南1例，在德宏傣族景颇族自治州），含1例由无症状感染者转为确诊病例（在福建）。无新增死亡病例。新增疑似病例2例，均为境外输入病例（均在上海）。
当日新增治愈出院病例45例，解除医学观察的密切接触者661人，重症病例较前一日增加1例。
境外输入现有确诊病例587例（其中重症病例3例），现有疑似病例2例。累计确诊病例8754例，累计治愈出院病例8167例，无死亡病例。
截至9月16日24时，据31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例916例（其中重症病例5例），累计治愈出院病例90025例，累计死亡病例4636例，累计报告确诊病例95577例，现有疑似病例2例。累计追踪到密切接触者1177935人，尚在医学观察的密切接触者15875人。
31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者20例，其中境外输入14例，本土6例（均在福建莆田市）；当日转为确诊病例3例（境外输入2例）；当日解除医学观察12例（境外输入11例）；尚在医学观察的无症状感染者378例（境外输入359例）。
累计收到港澳台地区通报确诊病例28327例。其中，香港特别行政区12149例（出院11862例，死亡213例），澳门特别行政区63例（出院63例），台湾地区16115例（出院13742例，死亡839例）。
值得一提的是，针对目前的疫情，河南省表示，即将启动新冠病毒疫苗加强免疫接种工作，针对完成两剂次灭活疫苗接种满6个月的18—59岁重点人群，根据加强免疫需间隔6个月的时间要求，2021年9月、10月、11月依次对3月1日之前、4月1日之前、5月1日之前完成两剂次灭活疫苗接种的重点人群进行加强免疫。
截至目前，河南已累计接种新冠病毒疫苗1.41亿剂次，已完成2剂次接种的6461万人（含仅需接种1剂的腺病毒疫苗），疫苗接种总人数达到7346.98万人。18岁以上人群，河南第二剂次任务完成率84.8%。
