9月28日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例25例。其中境外输入病例14例（云南8例，上海2例，福建2例，江苏1例，广东1例）；本土病例11例（黑龙江8例，均在哈尔滨市；福建3例，均在厦门市）。无新增死亡病例。无新增疑似病例。
当日新增治愈出院病例58例，解除医学观察的密切接触者644人，重症病例较前一日减少4例。
据报道，29日上午从福建省新冠疫情防控工作新闻发布会获悉，本次福建省莆田、厦门、泉州和漳州四地新冠疫情由新冠病毒德尔塔变异株引起，四地病例传播关系比较明确，都是因为境外输入引发了莆田、泉州、厦门、漳州四地疫情，总体表现为潜伏期较短（中位数在4.5天，一般潜伏期在1至14天）、传播速度快。
截至9月27日，福建省疾控中心已完成莆田、厦门、泉州和漳州四地336例病例标本的测序和分析工作，获得263例病毒完整基因组序列。
分析结果表明，263例病例的病毒基因组具有很高的同源性，均属于同一传播链，为德尔塔变异株（B.1.617.2进化分支）。针对本轮疫情，目前未发现有其他新的变异株。
最新数据统计，9月10日至9月28日24时，福建省累计报告本土阳性感染者470例，其中确诊病例467例（厦门市235例、莆田市205例、泉州市24例、漳州市3例），无症状感染者3例（均在莆田市）。
